Šotimaal Linlithgowi palees sünnib tütar surevale Šotimaa kuningale James V-le. Nimega Mary oli ta oma isa ainus ellujäänud laps ja ta tõusis Šotimaa troonile, kui kuningas suri vaid kuus päeva pärast tema sündi.

Prantsuse päritolu Mary ema Guise saatis ta üles kasvatama Prantsuse kohtusse ja 1558. aastal abiellus ta prantsuse dauphiiniga, kellest sai 1559. aastal Prantsusmaa kuningas Francis II ja suri 1560. Pärast Franciscuse surma naasis Mary Šotimaale, et täita tema määratud roll riigi monarhina. Maarja suur-onu oli Inglismaa kuningas Tudor Henry VIII ja 1565. aastal abiellus ta teise Tudori inglise nõo Lord Darnleyga, mis tugevdas tema nõudmist Inglise troonile. See vihastas suuresti praegust Inglise monarhist kuningannat Elizabeth I.

Aastal 1567 tapeti Darnley salapäraselt plahvatuses Kirk o 'Fieldil ja Maarja armuke, Bothweli krahv James Hepburn oli peamine kahtlusalune. Ehkki Bothwell mõisteti süüdistuses õigeks, vihastas tema abielu Maryga samal aastal aadlikku ja Mary sunniti loobuma oma poja kasuks Darnley James'i poolt. Mary vangistati väikesel Loch Leveni saarel.

Aastal 1568 põgenes ta vangistusest ja tõstis suure armee, kuid Šoti vaenlased said ta lüüa ja põgenesid Inglismaale. Kuninganna Elizabeth I tervitas algselt Maarjat, kuid oli peagi sunnitud panema oma nõbu koduarestisse pärast seda, kui Maarja sattus erinevate Inglise katoliku ja hispaania kruntide tähelepanu alla tema kukutamiseks. 1586. aastal avastati suur katoliiklik juhtum Elizabethi mõrvamiseks. Maarja viidi kohtu alla, mõisteti süüdi kaasosaluse eest ja mõisteti surma.

8. veebruaril 1587 tehti Šotimaa kuningannale Inglismaal Fotheringhay lossis riigireetmine. Tema poeg Šotimaa kuningas James VI võttis ema hukkamise rahulikult vastu ja kuninganna Elizabethi surma järel 1603. aastal sai temast James I, Inglismaa, Šotimaa ja Iirimaa kuningas.